서상우 Sang Woo Seo

전임교원생물 및 환경공과대학 화학생물공학부

77논문(2014~)

62SCI급

55서울대 소속(SCI급)

45제1·교신

2,318피인용

43논문 지원 과제

목차 한눈에 요약 연구주제·궤적 AI 프로필·과제 동향 정책 연계 논문 지원 과제 학부 협업 융합 후보 대표 논문

한눈에 보기

관심 분야

유전체 수준 전사조절네트워크 재구성 번역·mRNA 수준 발현 조절 도구 CRISPR 기반 발현 억제와 유전체 공학 해조류·바이오매스 기반 비브리오 플랫폼 대사공학 기반 화합물 생산 바이오센서·적응진화 기반 균주 개량

대장균 18 전사조절 네트워크 7 알지네이트 대사 이용 4 갈조류 바이오리파이너리 4 비브리오 플랫폼 균주 4 실험실 적응 진화(ALE) 4 대사공학 3 고속 대량 스크리닝(HTS) 3 이온농도분극(ICP) 3 유전체 규모 대사 모델(GEM) 3 3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 3 synthetic 5' untranslated region 2 bacterial gene expression 2 plasmid copy number control 2 translation initiation factor 2

주요 방법론

미세유체 실험 3 RNA 시퀀싱(RNA-seq) 3 chip exo sequencing 2 genome sequencing 2 genome resequencing 2 차세대 염기서열 분석(NGS) 2 genetic algorithm 1 thermodynamic modeling 1 size exclusion chromatography 1 genome scale model simulation 1

균주 조작과 발효 실험이 연구의 중심이며, 초록에 명시된 방법으로는 ChIP-exo 시퀀싱과 RNA 시퀀싱 기반 조절네트워크 재구성, 유전체 규모 대사모델 시뮬레이션과 모델 기반 실험 설계, 적응진화 후 유전체 재해독, 트랜스포존 삽입 서열 분석, 독립성분분석을 이용한 전사체 해석이 있다. 번역 개시 영역 설계에는 열역학 모델과 유전 알고리즘을 사용했다.

NTIS 표준분류

보건의료 > 신약·의약품개발 24% · 화공 > 생물화학 공정기술 23% · 생명과학 > 생물공학 19% · 생명과학 > 유전학·유전체학 6% · 생명과학 > 융합바이오 6% · 화학·화공 합 26% · 배정 62편

화학·화공에 배정된 논문 수: 생물화학 공정기술 14 화학공정 2
지원 과제 기준 논문 수: 생물화학 공정기술 16

논문 전체 SCI급 62편 · 최신순

62편

연도	논문	연구 키워드	방법	피인용
2026	Multiplexed CRISPR base editing enables pulse-activated irreversible biocontainment of engineered bacteria Nucleic Acids Research	biocontainment crispr base editing 유전자 조작 박테리아 essential gene inactivation		3
2026	A framework for building a synthetic cell from the SynCell Asia Initiative Nature Biotechnology	artificial cell construction biofoundry synthetic cell		2
2026	Direct conversion of brown macroalgae into polyhydroxybutyrate using engineered Vibrio sp. dhg Chemical Engineering Journal	알지네이트 대사 이용 갈조류 바이오리파이너리 폴리하이드록시부티레이트(PHB) 생산 비브리오 플랫폼 균주		1
2026	RegB/A-dependent redox regulation links iron uptake to methanol metabolism in Methylomonas sp. DH-1 Applied and Environmental Microbiology	iron uptake methanol metabolism 메탄자화균 redox regulation		0
2026	Tunable Transcription-Level CRISPR Interference in Vibrio natriegens Using Engineered Single Guide RNAs ACS Synthetic Biology	crispr interference single guide rna engineering transcriptional repression vibrio natriegen		0
2026	High-titer retinal production in Yarrowia lipolytica via redox engineering coupled with intra- and extracellular sequestration Bioresource Technology	카로티노이드 생합성 retinal production two stage fermentation 야로위아 리폴리티카		0
2026	Programmable in vivo mRNA circularization for enhanced gene expression in bacteria Nucleic Acids Research	bacterial gene expression mrna circularization mrna stability protein expression enhancement		0
2026	Electrochemical-biological hybrid conversion of captured carbon dioxide to bioproducts Bioresource Technology	이산화탄소 포집 carbon dioxide conversion electro biological hybrid system microbial protein		0
2025	Engineering Yarrowia lipolytica for the production of β-carotene by carbon and redox rebalancing Journal of Biological Engineering	beta carotene production pentose phosphate pathway redox cofactor balancing 야로위아 리폴리티카		16
2025	Deciphering the anti-obesity mechanisms of pharmabiotic probiotics through advanced multiomics analysis iScience	adipocyte lipid accumulation anti obesity effect gut microbiota probiotic strain	multiomics analysis	4
2025	Strategy for Sustainable Bio‐Value Chain Development: Algal Biomass Utilization Without Inhibitory Effects on Lactic Acid Production via Efficient Diluted Acid Hydrolysis of Brown Macroalga GCB Bioenergy	갈조류 바이오리파이너리 dilute acid hydrolysis fermentation inhibitor 젖산 생산		3
2025	Synthetic redesign of Corynebacterium glutamicum for 1,4-butanediol production via L-glutamate-derived CoA-independent pathway Journal of Biological Engineering	1,4 butanediol production coa independent pathway corynebacterium glutamicum 대사공학	transcriptome analysis	3
2025	Enhanced methanol tolerance and utilization in Pichia pastoris revealed by adaptive laboratory evolution Journal of Biological Engineering	실험실 적응 진화(ALE) methanol tolerance methanol utilization pichia pastoris	genome resequencing	3
2025	Promoter-proximal transcription–translation coupling controls early transcription in Escherichia coli Nucleic Acids Research	대장균 mrna quality control promoter proximal region transcription translation coupling		2
2025	Integrated Tn-seq and MAGE-assisted rapid genome engineering targeting in Escherichia coli Trends in biotechnology	대장균 gene interaction genome engineering transposon insertion sequencing	차세대 염기서열 분석(NGS)	2
2025	Transcriptional profiling of probiotic Escherichia coli Nissle 1917 under multiple environmental stresses: Simulated microgravity, microaerobic, and co-culture conditions New Biotechnology	microaerobic condition probiotic escherichia coli nissle simulated microgravity transcriptomic response	RNA 시퀀싱(RNA-seq)	1
2024	Tunable translation-level CRISPR interference by dCas13 and engineered gRNA in bacteria Nature Communications	crispr cas13 guide rna engineering polycistronic operon translation level repression		30
2024	Synthetic redesign of Escherichia coli W for faster metabolism of sugarcane molasses Microbial Cell Factories	carbon catabolite repression 대장균 sucrose metabolism sugarcane molass		12
2024	Natural transformation of Vibrio natriegens with large genetic cluster enables alginate assimilation for isopentenol production Bioresource Technology	알지네이트 대사 이용 isopentenol production natural transformation vibrio natriegen		9
2024	Generation of a Vibrio-based platform for efficient conversion of raffinose through Adaptive Laboratory Evolution on a solid medium Metabolic Engineering	실험실 적응 진화(ALE) galactose catabolism raffinose utilization 비브리오 플랫폼 균주		7
2024	Dynamic control of the plasmid copy number maintained without antibiotics in Escherichia coli Journal of Biological Engineering	대장균 itaconic acid production plasmid copy number control translation initiation factor		6
2024	Synthetic translational coupling system for accurate and predictable polycistronic gene expression control in bacteria Metabolic Engineering	3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 polycistronic gene expression 폴리하이드록시부티레이트(PHB) 생산 translational coupling		4
2023	CRISPRi-mediated tunable control of gene expression level with engineered single-guide RNA in Escherichia coli Nucleic Acids Research	crispr interference 대장균 single guide rna engineering transcriptional repression		43
2023	Programmable synthetic biology tools for developing microbial cell factories Current Opinion in Biotechnology	biomass conversion genetically encoded biosensor 미생물 세포공장 synthetic gene circuit		40
2023	Synthetic biology tools for engineering Corynebacterium glutamicum Computational and Structural Biotechnology Journal	corynebacterium glutamicum gene expression control genome editing tool 미생물 세포공장		27
2023	Lipid extract derived from newly isolated Rhodotorula toruloides LAB-07 for cosmetic applications Computational and Structural Biotechnology Journal	cosmetic ingredient microbial lipid rhodotorula toruloide		15
2023	dCas9-Mediated PCR-Free Detection of Oncogenic Mutation by Nonequilibrium Nanoelectrokinetic Selective Preconcentration Analytical Chemistry	dcas9 labeling 이온농도분극(ICP) oncogenic mutation detection pcr free detection	미세유체 실험	10
2023	Model-driven experimental design workflow expands understanding of regulatory role of Nac in Escherichia coli NAR Genomics and Bioinformatics	대장균 유전체 규모 대사 모델(GEM) 질소 제한 전사조절 네트워크	model driven experimental design	7
2023	Undefined xylose media extracted from biorefinery waste for enhanced and eco‐friendly production of cephalosporin C by Acremonium chrysogenum M35 GCB Bioenergy	acremonium chrysogenum barley straw hydrolysate cephalosporin c production dilute acid pretreatment		4
2023	Design of an effective small expression tag to enhance GPCR production in E. coli‐based cell‐free and whole cell expression systems Protein Science	cell free protein synthesis fusion tag g protein coupled receptor expression translation initiation rate		2
2022	Revealing Causes for False-Positive and False-Negative Calling of Gene Essentiality in Escherichia coli Using Transposon Insertion Sequencing mSystems	대장균 gene essentiality transposon insertion sequencing transposon mutant library	차세대 염기서열 분석(NGS)	18
2022	A Vibrio-based microbial platform for accelerated lignocellulosic sugar conversion Biotechnology for Biofuels and Bioproducts	실험실 적응 진화(ALE) lignocellulosic sugar conversion 비브리오 플랫폼 균주 xylose catabolism		17
2022	Efficient Production of Naringin Acetate with Different Acyl Donors via Enzymatic Transesterification by Lipases International Journal of Environmental Research and Public Health	acyl donor enzymatic transesterification lipase catalysis naringin acetate		16
2021	Synthetic biosensor accelerates evolution by rewiring carbon metabolism toward a specific metabolite Cell Reports	3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 실험실 적응 진화(ALE) carbon flux distribution synthetic biosensor	genome resequencing	41
2021	Synthetic protein quality control to enhance full-length translation in bacteria Nature Chemical Biology	full length translation mrna circularization protein quality control transcription translation coupling		20
2021	Synthetic cellular communication-based screening for strains with improved 3-hydroxypropionic acid secretion Lab on a Chip	3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 배출 펌프 strain screening synthetic cellular communication		20
2021	Engineering Vibrio sp. SP1 for the production of carotenoids directly from brown macroalgae Computational and Structural Biotechnology Journal	알지네이트 대사 이용 beta carotene production 갈조류 바이오리파이너리 라이코펜 생산		10
2020	Independent component analysis of E. coli's transcriptome reveals the cellular processes that respond to heterologous gene expression Metabolic Engineering	대장균 heterologous gene expression metal homeostasis transcriptome analysis	independent component analysis	44
2020	Engineering Tools for the Development of Recombinant Lactic Acid Bacteria Biotechnology Journal	biotherapeutic production genetic engineering tool lactic acid bacterium recombinant protein secretion		37
2020	Transcriptional Profiling of the Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 Strain under Simulated Microgravity International Journal of Molecular Sciences	biofilm formation probiotic escherichia coli nissle simulated microgravity transcriptomic response	RNA 시퀀싱(RNA-seq)	34
2020	Nanoelectrokinetic Selective Preconcentration Based on Ion Concentration Polarization BioChip Journal	전기동역학적 수송 이온농도분극(ICP) selective preconcentration		29
2019	Cellular responses to reactive oxygen species are predicted from molecular mechanisms Proceedings of the National Academy of Sciences	대장균 유전체 규모 대사 모델(GEM) iron sulfur cluster reactive oxygen species stress response	genome scale model simulation	119
2019	Vibrio sp. dhg as a platform for the biorefinery of brown macroalgae Nature Communications	2,3-부탄디올 생산 알지네이트 대사 이용 갈조류 바이오리파이너리 비브리오 플랫폼 균주	genome sequencing	79
2019	Synthetic biology for evolutionary engineering: from perturbation of genotype to acquisition of desired phenotype Biotechnology for Biofuels	evolutionary engineering 고속 대량 스크리닝(HTS) strain improvement synthetic gene circuit		40
2019	Complete Genome Sequence of Lactic Acid Bacterium Pediococcus acidilactici Strain ATCC 8042, an Autolytic Anti-bacterial Peptidoglycan Hydrolase Producer Biotechnology and Bioprocess Engineering	complete genome sequence lactic acid bacterium peptidoglycan hydrolase	genome sequencing	7
2018	Systematic discovery of uncharacterized transcription factors in Escherichia coli K-12 MG1655 Nucleic Acids Research	dna binding motif 대장균 transcription factor discovery 전사조절 네트워크	chip exo sequencing	102
2018	Systems assessment of transcriptional regulation on central carbon metabolism by Cra and CRP Nucleic Acids Research	catabolite repression central carbon metabolism 유전체 규모 대사 모델(GEM) 전사조절 네트워크	chip exo sequencing RNA 시퀀싱(RNA-seq)	102
2018	Design and optimization of genetically encoded biosensors for high-throughput screening of chemicals Current Opinion in Biotechnology	genetic part optimization genetically encoded biosensor 고속 대량 스크리닝(HTS)		89
2018	Synthetic auxotrophs for stable and tunable maintenance of plasmid copy number Metabolic Engineering	대장균 plasmid copy number control synthetic auxotrophy translation initiation factor		72
2018	dCas9-mediated Nanoelectrokinetic Direct Detection of Target Gene for Liquid Biopsy Nano Letters	dcas9 labeling dna preconcentration 이온농도분극(ICP) liquid biopsy	미세유체 실험	63
2018	Diffusiophoretic exclusion of colloidal particles for continuous water purification Lab on a Chip	colloidal particle exclusion diffusiophoresis 나노다공성 막 수질 정화(정수)	미세유체 실험	58
2017	Precise flux redistribution to glyoxylate cycle for 5-aminolevulinic acid production in Escherichia coli Metabolic Engineering	5 aminolevulinic acid production 대장균 glyoxylate cycle metabolic flux redistribution		76
2017	Revealing genome-scale transcriptional regulatory landscape of OmpR highlights its expanded regulatory roles under osmotic stress in Escherichia coli K-12 MG1655 Scientific Reports	대장균 ompr regulon osmotic stress response 전사조절 네트워크		49
2017	Synthetic redesign of Escherichia coli for cadaverine production from galactose Biotechnology for Biofuels	카다베린 생산 대장균 galactose utilization 대사공학		41
2017	RNA-based dynamic genetic controllers: development strategies and applications Current Opinion in Biotechnology	dynamic gene regulation 고속 대량 스크리닝(HTS) 대사공학 riboswitch		41
2017	Elucidation of bacterial translation regulatory networks Current Opinion in Systems Biology	bacterial gene expression rna binding protein small regulatory rna translation regulation		6
2015	Genome-wide Reconstruction of OxyR and SoxRS Transcriptional Regulatory Networks under Oxidative Stress in Escherichia coli K-12 MG1655 Cell Reports	대장균 oxidative stress response oxyr regulon 전사조절 네트워크		237
2015	Decoding genome-wide GadEWX-transcriptional regulatory networks reveals multifaceted cellular responses to acid stress in Escherichia coli Nature Communications	acid stress response 대장균 glutamate dependent acid resistance 전사조절 네트워크		104
2015	Pathway optimization by re-design of untranslated regions for L-tyrosine production in Escherichia coli Scientific Reports	대장균 l tyrosine production metabolic flux rebalancing synthetic 5' untranslated region		61
2014	Deciphering Fur transcriptional regulatory network highlights its complex role beyond iron metabolism in Escherichia coli Nature Communications	대장균 ferric uptake regulator iron homeostasis 전사조절 네트워크		321
2014	Predictive combinatorial design of mRNA translation initiation regions for systematic optimization of gene expression levels Scientific Reports	gene expression optimization metabolic pathway optimization synthetic 5' untranslated region translation initiation region	genetic algorithm thermodynamic modeling	78
2014	The synthesis of single-walled carbon nanotubes with narrow diameter distribution using polymerized hemoglobin Carbon	iron oxide nanoparticle catalyst nanotube diameter control 단일벽 탄소나노튜브(SWCNT)	size exclusion chromatography	7

집계에서 뺀 레코드 4건 (동명이인·학회 초록·표지·번역본·중복)

연도	제목	뺀 이유
2025	Neuroprotection of fermented small black soybean (Rhynchosia nulubilis) on hippocampal neurons through antioxidant effect Food Science and Biotechnology	동명이인 의심(AI 판정)
2022	Recent Progress of Smart Nano-Based Biosensors and their Applications in Biomedicine NANO	동명이인 의심(AI 판정)
2020	Dieckol, a Major Marine Polyphenol, Enhances Non-Rapid Eye Movement Sleep in Mice via the GABAA-Benzodiazepine Receptor Frontiers in Pharmacology	동명이인 의심(AI 판정)
2019	Fabrication of Troponin I Biosensor Composed of Multi-Functional DNA Structure/Au Nanocrystal Using Electrochemical and Localized Surface Plasmon Resonance Dual-Detection Method Nanomaterials	동명이인 의심(AI 판정)

요약

서상우 교수는 공과대학 화학생물공학부 소속으로 시스템 및 합성생물학을 연구한다. 2014년 이후 OpenAlex 기준 논문 77편(SCI급 62편, 그중 서울대 소속 55편), 피인용 합계 2,318회이다. 주력 학문분야는 Molecular Biology, Genetics, Biomedical Engineering이다. NTIS 과학기술표준분류로는 보건의료 > 신약·의약품개발(24%), 화공 > 생물화학 공정기술(23%), 생명과학 > 생물공학(19%) 순으로 가깝고, 그중 화학·화공은 26%다. 논문을 지원한 국가R&D 과제는 43건(연차 기준, 2020–24 성과)이다. 학부 내 공저 상대: 한지숙 1편.

핵심 연구주제

SCI급 논문의 OpenAlex 1순위 토픽 기준(편수). 서울대 부임 전 논문도 포함한다.

연구주제	학문분야	편
Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction	Molecular Biology	27
Bacterial Genetics and Biotechnology	Genetics	8
CRISPR and Genetic Engineering	Molecular Biology	4
RNA and protein synthesis mechanisms	Molecular Biology	4
Probiotics and Fermented Foods	Food Science	4
Microfluidic and Capillary Electrophoresis Applications	Biomedical Engineering	3
Redox biology and oxidative stress	Molecular Biology	1
Nanopore and Nanochannel Transport Studies	Biomedical Engineering	1

연구 궤적

시기	논문	주요 주제
2014–2017	11	Bacterial Genetics and Biotechnology (5) · Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction (4) · RNA and protein synthesis mechanisms (1)
2018–2021	18	Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction (9) · Microfluidic and Capillary Electrophoresis Applications (2) · Probiotics and Fermented Foods (2)
2022–2026	33	Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction (14) · CRISPR and Genetic Engineering (4) · Bacterial Genetics and Biotechnology (2)

AI 연구 프로필·과제 동향

서상우 교수는 화학생물공학부에서 미생물의 전사·번역 조절 요소를 설계해 대사 흐름을 재배치하는 시스템·합성생물학을 연구하며, 수집된 SCI 논문 대부분이 대장균의 조절네트워크 해독과 발현 조절 도구 개발, 그리고 이를 이용한 화합물 생산을 다룬다. 초기에는 합성 5'-비번역영역 설계로 번역 수준 발현을 조절해 L-타이로신·카다베린·5-아미노레불린산 생산 경로를 최적화하고, Fur·OxyR·GadEWX·OmpR 같은 전사인자의 유전체 수준 조절네트워크를 재구성했다. 이후에는 알긴산을 빠르게 자화하는 비브리오 균주를 분리·조작해 갈조류와 리그노셀룰로스 당을 에탄올·카로티노이드·폴리하이드록시부티레이트로 전환하는 플랫폼을 구축했다. 최근에는 dCas9·dCas13 기반 가변 CRISPR 간섭, mRNA 환형화, 번역 커플링, 염기교정 기반 생물봉쇄 같은 정밀 발현 조절 도구와 야로위아·코리네박테리움·피키아 대사공학으로 범위를 넓혔다. 목록에는 나노전기동역학·바이오센서 등 연구 이력과 어긋나는 논문도 섞여 있다.

연구 축

축	설명·키워드	대표 논문
유전체 수준 전사조절네트워크 재구성 Genome-scale reconstruction of transcriptional regulatory networks	ChIP-exo와 RNA-seq을 결합해 철·산화·산·삼투·질소 스트레스 조절인자의 조절유전자군을 규명하고, 유전체 규모 대사모델과 통합해 세포 반응을 설명한다. 전사조절 네트워크 oxidative stress response acid stress response osmotic stress response 유전체 규모 대사 모델(GEM) 대장균	Deciphering Fur transcriptional regulatory network highlights its comp Genome-wide Reconstruction of OxyR and SoxRS Transcriptional Regulator Decoding genome-wide GadEWX-transcriptional regulatory networks reveal Revealing genome-scale transcriptional regulatory landscape of OmpR hi Systematic discovery of uncharacterized transcription factors in Esche Systems assessment of transcriptional regulation on central carbon met
번역·mRNA 수준 발현 조절 도구 Translation- and mRNA-level expression control tools	합성 5'-비번역영역, 전사-번역 커플링, mRNA 환형화, 번역 커플링 회로를 설계해 발현 수준을 예측 가능하게 조절하고 mRNA 품질을 관리한다. synthetic 5' untranslated region translation initiation region transcription translation coupling mrna circularization translational coupling mrna quality control	Predictive combinatorial design of mRNA translation initiation regions Synthetic protein quality control to enhance full-length translation i Promoter-proximal transcription–translation coupling controls early tr Synthetic translational coupling system for accurate and predictable p Programmable in vivo mRNA circularization for enhanced gene expression Design of an effective small expression tag to enhance GPCR production
CRISPR 기반 발현 억제와 유전체 공학 CRISPR-based repression and genome engineering	가이드 RNA를 조작해 dCas9·dCas13 결합 친화도를 조절하는 가변 CRISPR 간섭 시스템과 염기교정 기반 생물봉쇄, 트랜스포존 삽입 서열 분석 기반 유전체 공학을 개발한다. crispr interference single guide rna engineering crispr cas13 crispr base editing transposon insertion sequencing genome engineering	CRISPRi-mediated tunable control of gene expression level with enginee Tunable translation-level CRISPR interference by dCas13 and engineered Tunable Transcription-Level CRISPR Interference in Vibrio natriegens U Multiplexed CRISPR base editing enables pulse-activated irreversible b Revealing Causes for False-Positive and False-Negative Calling of Gene Integrated Tn-seq and MAGE-assisted rapid genome engineering targeting
해조류·바이오매스 기반 비브리오 플랫폼 Vibrio platform strains for macroalgae and biomass conversion	알긴산·만니톨·자일로스를 빠르게 자화하는 비브리오 균주를 분리·조작해 갈조류와 리그노셀룰로스 당을 에탄올·카로티노이드·폴리하이드록시부티레이트로 전환한다. 갈조류 바이오리파이너리 알지네이트 대사 이용 비브리오 플랫폼 균주 lignocellulosic sugar conversion 폴리하이드록시부티레이트(PHB) 생산 vibrio natriegen	Vibrio sp. dhg as a platform for the biorefinery of brown macroalgae Engineering Vibrio sp. SP1 for the production of carotenoids directly A Vibrio-based microbial platform for accelerated lignocellulosic suga Natural transformation of Vibrio natriegens with large genetic cluster Direct conversion of brown macroalgae into polyhydroxybutyrate using e Generation of a Vibrio-based platform for efficient conversion of raff
대사공학 기반 화합물 생산 Metabolic engineering for chemical production	중심 탄소대사와 산화환원 균형을 재배치해 아미노산·디아민·유기산·카로티노이드·1,4-부탄다이올 등을 대장균·코리네박테리움·야로위아에서 생산한다. l tyrosine production 카다베린 생산 3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 beta carotene production 야로위아 리폴리티카 corynebacterium glutamicum	Pathway optimization by re-design of untranslated regions for L-tyrosi Synthetic redesign of Escherichia coli for cadaverine production from Synthetic cellular communication-based screening for strains with impr Engineering Yarrowia lipolytica for the production of β-carotene by ca Synthetic redesign of Corynebacterium glutamicum for 1,4-butanediol pr High-titer retinal production in Yarrowia lipolytica via redox enginee
바이오센서·적응진화 기반 균주 개량 Biosensor-guided screening and adaptive laboratory evolution	대사물질 감지 바이오센서로 생산성과 성장을 연결해 균주를 선별하고, 적응진화와 유전체 재해독으로 당·메탄올 이용 능력을 개량하며 플라스미드 복제수를 동적으로 조절한다. genetically encoded biosensor synthetic biosensor 실험실 적응 진화(ALE) plasmid copy number control methanol utilization strain screening	Design and optimization of genetically encoded biosensors for high-thr Synthetic biosensor accelerates evolution by rewiring carbon metabolis Enhanced methanol tolerance and utilization in Pichia pastoris reveale Synthetic auxotrophs for stable and tunable maintenance of plasmid cop Dynamic control of the plasmid copy number maintained without antibiot Synthetic redesign of Escherichia coli W for faster metabolism of suga

연구 흐름

시기	흐름	그 시기 주요 키워드
2014–2017	합성 5'-비번역영역 설계로 번역 수준 발현을 조절해 L-타이로신·카다베린·5-아미노레불린산 생산 경로를 최적화하는 연구와 Fur·OxyR/SoxRS·GadEWX·OmpR 조절유전자군의 유전체 수준 재구성이 중심이었다. 리보스위치 같은 RNA 기반 동적 조절기 리뷰도 이 시기에 나왔다.	대장균 전사조절 네트워크 synthetic 5' untranslated region 대사공학 gene expression optimization
2018–2021	알긴산을 자화하는 비브리오 균주를 분리해 갈조류 당을 에탄올·2,3-부탄다이올·카로티노이드로 전환하는 플랫폼을 만들고, 대사물질 감지 바이오센서로 적응진화를 유도해 3-하이드록시프로피온산 생산 균주를 얻었다. 미확인 전사인자 탐색, 활성산소 스트레스 반응 모델(OxidizeME), 합성 단백질 품질관리 연구도 수행되었다.	대장균 전사조절 네트워크 고속 대량 스크리닝(HTS) 이온농도분극(ICP) 유전체 규모 대사 모델(GEM)
2022–2026	가변 CRISPR 간섭(dCas9·dCas13), mRNA 환형화, 번역 커플링 등 정밀 발현 조절 도구와 트랜스포존 삽입 서열 분석 기반 유전체 공학이 주요 주제가 되었다. 코리네박테리움·야로위아·피키아를 이용한 1,4-부탄다이올·베타카로틴·레티날 생산, 염기교정 기반 생물봉쇄, 포집 이산화탄소의 전기화학-생물 혼성 전환 연구로 확장되었다.	대장균 실험실 적응 진화(ALE) 비브리오 플랫폼 균주 transposon insertion sequencing 미생물 세포공장

핵심 키워드와 국가 과제 동향

키워드	논문	국가 10년(억)	증가율	진단
대장균	18	186	신규	2020년 이후 새로 커짐 · 학부 논문 10편 이상
전사조절 네트워크	7	198	신규	2020년 이후 새로 커짐 · 학부 논문 10편 미만
알지네이트 대사 이용	4	112	소규모	국가 과제 소규모 · 학부 논문 10편 미만
갈조류 바이오리파이너리	4	679	+61%	국가 평균보다 빠르게 증가 · 학부 논문 10편 미만
비브리오 플랫폼 균주	4	0	–	국가 과제 매칭 적음
실험실 적응 진화(ALE)	4	47	소규모	국가 과제 소규모 · 학부 논문 10편 미만
대사공학	3	1,328	-19%	감소 · 학부 논문 10편 미만
고속 대량 스크리닝(HTS)	3	1,115	+51%	국가 평균보다 느리게 증가 · 학부 논문 10편 미만

전체 키워드: 대장균 18 전사조절 네트워크 7 알지네이트 대사 이용 4 갈조류 바이오리파이너리 4 비브리오 플랫폼 균주 4 실험실 적응 진화(ALE) 4 대사공학 3 고속 대량 스크리닝(HTS) 3 이온농도분극(ICP) 3 유전체 규모 대사 모델(GEM) 3 3-하이드록시프로피온산(3-HP) 생산 3 synthetic 5' untranslated region 2 bacterial gene expression 2 plasmid copy number control 2 translation initiation factor 2 genetically encoded biosensor 2 dcas9 labeling 2 synthetic gene circuit 2 lactic acid bacterium 2 probiotic escherichia coli nissle 2

연구 방법

지원 과제 동향 (NTIS 성과, 2020–2024)

2021222324

연도별 지원 과제 건수. 정부연구비 합계 2020 38억 · 2021 58억 · 2022 36억 · 2023 72억 · 2024 38억. 과제 전체의 연차 정부연구비를 더한 값이라 교수 개인 연구비가 아니며, 공저자 과제가 포함될 수 있다.

초록이 비어 있는 레코드가 20편이어서 제목과 OpenAlex 키워드만으로 태깅했다. 나노전기동역학(이온농도분극)·광학 바이오센서 논문군과 식품·약리 성격의 논문은 합성생물학 이력과 동떨어져 suspect 9편으로 표시했으며, 유산균·프로바이오틱스 관련 논문도 동명이인 가능성이 있으나 미생물 발효 주제라 suspect에는 넣지 않았다.

NTIS 표준분류 연계

이 교수 논문이 가장 많이 배정된 NTIS 중분류부터(화학·화공 밖 포함, 상위 15개). 논문 = 이 교수 논문을 그 분류에 배정한 수(정책 연계 맵과 같은 방법), 논문(지원 과제) = 그 분류 과제가 지원한 논문 수. 국가 투자 = 그 분류(1순위) 과제의 정부연구비 2015–24. 대학 내 서울대% 평균 8.7%.

배정 구성: 보건의료 > 신약·의약품개발 24% · 화공 > 생물화학 공정기술 23% · 생명과학 > 생물공학 19% · 생명과학 > 유전학·유전체학 6% · 생명과학 > 융합바이오 6% · 화학·화공 합 26% · 배정 62편

대분류	중분류	범위	논문	논문(지원 과제)	국가 2015–24(억)	2020–24(억)	증가율	대학 내 서울대%
보건의료	보건의료 > 신약·의약품개발	범위 밖	15	7	43,312	27,450	+73%	10.5
화공	생물화학 공정기술	화학·화공	14	16	2,846	1,506	+12%	2.4
생명과학	생명과학 > 생물공학	범위 밖	12	14	4,384	2,666	+55%	10.2
생명과학	생명과학 > 융합바이오	범위 밖	4	7	12,029	7,663	+76%	9.7
생명과학	생명과학 > 유전학·유전체학	범위 밖	4	0	7,479	4,204	+28%	13.9
기계	기계 > 나노/마이크로기계시스템	범위 밖	2	2	6,196	3,556	+35%	7.4
화공	화학공정	화학·화공	2	0	7,842	5,489	+133%	11.2
생명과학	생명과학 > 산업바이오	범위 밖	1	2	10,147	5,761	+31%	5.1
인지･감성과학	인지･감성과학 > 인지과학	범위 밖	1	1	156	156	2023~	18.8
농림수산식품	농림수산식품 > 식품과학	범위 밖	1	0	6,890	3,756	+20%	11.6
농림수산식품	농림수산식품 > 원예특용작물과학	범위 밖	1	0	12,479	7,351	+43%	11.4
보건의료	보건의료 > 의생명과학	범위 밖	1	0	25,074	14,241	+31%	12.3
생명과학	생명과학 > 분자세포생물학	범위 밖	1	0	11,140	6,519	+41%	12.5
에너지/자원	에너지/자원 > 온실가스 처리	범위 밖	1	0	6,433	4,200	+88%	4.8
전기/전자	전기/전자 > 전지	범위 밖	1	0	11,920	8,875	+192%	10.6

논문 지원 과제 (NTIS 성과DB)

교수 논문 DOI가 NTIS 성과 논문으로 등록된 과제(2020–24). 공저자의 과제일 수 있어 본인 책임 과제와 같지 않다. 부처: 과학기술정보통신부 29, 교육부 9, 해양수산부 2, 보건복지부 1, 산업통상자원부 1. NTIS 분류 = 그 과제의 1순위 과학기술표준분류.

연도	과제·사업	부처	수행기관	억	NTIS 분류
2024	석유화학 소재 대체 친환경 해양바이오 플라스틱 소재 개발 해양바이오산업소재국산화기술개발	해양수산부	포항공과대학	15.2	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2024	합성생물학 기반 유해선충제어 바이오소재 맞춤형 세포공장 구축 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	한국과학기술원	9.2	범위 밖
2024	저등급 CO2/CH4 바이오전환 기술 개발 글로벌C1가스리파이너리밸류업(R&D)	과학기술정보통신부	(재)한국에너지기술연구원	4.5	범위 밖
2024	합성생물학 기반 미생물 생물치료제 개발 개인기초연구(과기정통부)	과학기술정보통신부	서울대학	2.4	범위 밖
2024	비병원성 비브리오 세포공장 첨단화용 합성생물학 원천기술 개발 및 고도화 섀시 제작 합성생물학핵심기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	2.2	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2024	바이오제조 혁신을 위한 합성생물학 기반 세포공장용 초고속 성장 미생물 플랫폼 섀시 개발 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	2.2	범위 밖
2024	토양 환경 정화를 위한 바실러스 균주 내 인공 유전자 회로 구축 및 활용 합성생물학핵심기술개발	과학기술정보통신부	한국화학연구원	2.2	범위 밖
2023	합성생물학 기반 유해선충제어 바이오소재 맞춤형 세포공장 구축 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	한국과학기술원	12.3	범위 밖
2023	화공분야연구인력양성사업단 4단계두뇌한국21사업	교육부	서울대학	11.6	–
2023	PCR-free 나노전기수력학 기반 고효율/고정밀 감염증 진단 플랫폼 개발 감염병예방치료기술개발사업	보건복지부	서울대학	8.7	범위 밖
2023	인공미생물 스마트팩토리 기반 고부가물질 생산을 위한 합성생물학 원천기술 개발 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	7.5	범위 밖
2023	석유화학 소재 대체 친환경 해양바이오 플라스틱 소재 개발 해양바이오산업소재국산화기술개발	해양수산부	포항공과대학	6.6	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2023	나노전기수력학 기반의 혈액암 정밀진단 기초 연구실 집단연구지원	과학기술정보통신부	서울대학	5.0	범위 밖
2023	제주 에너지신산업 고도화 혁신인재 양성 교육연구단 4단계두뇌한국21사업	교육부	제주대학	4.5	–
2023	고급나노전기수력학을 이용한 생체 시료의 분리 농축 및 온라인 추출 플랫폼 기술 개발 개인기초연구(과기정통부)	과학기술정보통신부	서울대학	4.0	범위 밖
2023	카이스트 BK21 FOUR 생물사업단 4단계두뇌한국21사업	교육부	한국과학기술원	3.6	–
2023	바이오제조 혁신을 위한 합성생물학 기반 세포공장용 초고속 성장 미생물 플랫폼 섀시 개발 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	3.0	범위 밖
2023	에너지-머신러닝 융합형 혁신 인재 양성 4단계두뇌한국21사업	교육부	울산과학기술원	1.9	–
2023	미래형 신재생 에너지 물리 인재 교육 연구팀 4단계두뇌한국21사업	교육부	인하대학	1.2	–
2023	바이오 디지털 생체감각 국제표준화 기반 구축 국가표준기술개발및보급	산업통상자원부	이화여자대학	1.0	범위 밖
2023	바이오 케미컬 생산성 증대를 위한 크리스퍼 기술 기반 최소유전체 대장균 구축 개인기초연구(과기정통부)	과학기술정보통신부	한국과학기술원	0.9	범위 밖
2022	합성생물학 기반 유해선충제어 바이오소재 맞춤형 세포공장 구축 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	한국과학기술원	12.3	범위 밖
2022	화공분야연구인력양성사업단 4단계두뇌한국21사업(R&D)	교육부	서울대학	10.0	–
2022	인공미생물 스마트팩토리 기반 고부가물질 생산을 위한 합성생물학 원천기술 개발 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	7.5	범위 밖
2022	바이오제조 혁신을 위한 합성생물학 기반 세포공장용 초고속 성장 미생물 플랫폼 섀시 개발 바이오의료기술개발	과학기술정보통신부	서울대학	3.0	범위 밖
2022	저가 바이오매스의 효율적 활용을 위한 신종 미생물 기반의 고성능 미생물 화학공장 개발 개인기초연구(과기정통부)	과학기술정보통신부	포항공과대학	2.0	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2022	고부가가치 화합물 생산을 위한 미생물 기반 통합적 이산화탄소 전환 공정 개발 집단연구지원	과학기술정보통신부	포항공과대학	1.6	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2021	메탄-메탄올 전환 플랫폼 균주 개발 기후변화대응기술개발(R&D)	과학기술정보통신부	경희대학	15.0	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2021	생체시계 기반 항노화 융합연구 센터 집단연구지원(R&D)	과학기술정보통신부	고려대학	11.2	범위 밖
2021	인공미생물 스마트팩토리 기반 고부가물질 생산을 위한 합성생물학 원천기술 개발 바이오.의료기술개발(R&D)	과학기술정보통신부	서울대학	7.5	범위 밖
2021	C1 가스의 3-HP 전환을 위한 미생물 컨소시엄 공정 개발 기후변화대응기술개발(R&D)	과학기술정보통신부	포항공과대학	5.5	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2021	나노전기수력학 기반의 혈액암 정밀진단 기초 연구실 집단연구지원(R&D)	과학기술정보통신부	서울대학	5.0	범위 밖
2021	고부가가치 화합물 생산을 위한 미생물 기반 통합적 이산화탄소 전환 공정 개발 집단연구지원(R&D)	과학기술정보통신부	포항공과대학	4.8	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2021	노화기전 분석/ 제어를 위한 고속 단일세포 스크리닝 및 생체분자구조 분석 시스템 개인기초연구(과기정통부)(R&D)	과학기술정보통신부	충남대학	4.0	화공 > 생물화학 공정기술 > 나노생물 융합 공정기술
2021	4차 산업혁명 대응 융합형 화공소재 교육연구단 4단계두뇌한국21사업(R&D)	교육부	충남대학	2.6	–
2021	저가 바이오매스의 효율적 활용을 위한 신종 미생물 기반의 고성능 미생물 화학공장 개발 개인기초연구(과기정통부)(R&D)	과학기술정보통신부	포항공과대학	2.0	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2020	창의정보기술 인재양성사업단 BK21플러스사업(R&D)	교육부	서울대학교	11.9	–
2020	메탄-메탄올 전환 플랫폼 균주 개발 기후변화대응기술개발(R&D)	과학기술정보통신부	경희대학교(국제캠퍼스)	9.8	화공 > 생물화학 공정기술 > 대사공학기술
2020	인공미생물 스마트팩토리 기반 고부가물질 생산을 위한 합성생물학 원천기술 개발 바이오.의료기술개발(R&D)	과학기술정보통신부	서울대학교	5.0	범위 밖
2020	나노전기수력학 기반의 혈액암 정밀진단 기초 연구실 집단연구지원(R&D)	과학기술정보통신부	서울대학교	5.0	범위 밖

상위 40건만 표시 (전체 43건)

학부 내 협업 (공저)

교수	연구분야	공저 편수	공저 논문 예
한지숙	생물 및 환경	1	RegB/A-dependent redox regulation links iron uptake to metha

학제 간 융합 후보

연구분야가 겹치지 않고 아직 함께 쓴 논문이 없는 교수 쌍 가운데 연구 유사도(학문분야 cosine 0.5 + NTIS 중분류 cosine 0.5)가 높은 순. NTIS 쪽은 화학·화공 밖 분류까지 넣어 계산한다. 겹치는 NTIS 분류는 두 교수 논문이 2편 이상씩 배정된 중분류(범위 밖이면 링크 없음)다. 전체 네트워크 →

교수	연구분야	점수	겹치는 NTIS 분류	겹치는 연구주제
현택환	무기 및 전기전자 소재	0.29	신약·의약품개발 생물공학 생물화학 공정기술	Enzyme Catalysis and Immobilization · Microbial Fuel Cells and Bioremediation · Advanced biosensing and bioanalysis techniques

대표 논문 (피인용 상위)

연도	논문	피인용
2014	Deciphering Fur transcriptional regulatory network highlights its complex role beyond iron metabolism in Escherichia coli Nature Communications	321
2015	Genome-wide Reconstruction of OxyR and SoxRS Transcriptional Regulatory Networks under Oxidative Stress in Escherichia coli K-12 MG1655 Cell Reports	237
2019	Cellular responses to reactive oxygen species are predicted from molecular mechanisms Proceedings of the National Academy of Sciences	119
2015	Decoding genome-wide GadEWX-transcriptional regulatory networks reveals multifaceted cellular responses to acid stress in Escherichia coli Nature Communications	104
2018	Systematic discovery of uncharacterized transcription factors in Escherichia coli K-12 MG1655 Nucleic Acids Research	102
2018	Systems assessment of transcriptional regulation on central carbon metabolism by Cra and CRP Nucleic Acids Research	102
2018	Design and optimization of genetically encoded biosensors for high-throughput screening of chemicals Current Opinion in Biotechnology	89
2019	Vibrio sp. dhg as a platform for the biorefinery of brown macroalgae Nature Communications	79

최근 논문

연도	논문	피인용
2026	Multiplexed CRISPR base editing enables pulse-activated irreversible biocontainment of engineered bacteria 생물화학 공정기술 › 대사공학기술 Nucleic Acids Research	3
2026	A framework for building a synthetic cell from the SynCell Asia Initiative Nature Biotechnology	2
2026	Direct conversion of brown macroalgae into polyhydroxybutyrate using engineered Vibrio sp. dhg 화학공정 › 공정시스템기술 Chemical Engineering Journal	1
2026	RegB/A-dependent redox regulation links iron uptake to methanol metabolism in Methylomonas sp. DH-1 생물화학 공정기술 › 대사공학기술 Applied and Environmental Microbiology	0
2026	Tunable Transcription-Level CRISPR Interference in Vibrio natriegens Using Engineered Single Guide RNAs ACS Synthetic Biology	0
2026	High-titer retinal production in Yarrowia lipolytica via redox engineering coupled with intra- and extracellular sequestration Bioresource Technology	0
2026	Programmable in vivo mRNA circularization for enhanced gene expression in bacteria Nucleic Acids Research	0
2026	Electrochemical-biological hybrid conversion of captured carbon dioxide to bioproducts Bioresource Technology	0

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