김준원 Joonwon Kim
전임교원생물 및 환경공과대학 화학생물공학부
한눈에 보기
관심 분야
이소플라본 환원효소를 이용한 에쿠올 생산 P450 기반 오메가-하이드록시 지방산 생산 인디고이드 염료의 효소 합성 게놈 규모 대사 모델과 시스템 대사공학 인간 세포 기능유전체학과 내재 단백질 태깅
오메가-하이드록시 지방산 6 전세포 생촉매 5 사이토크롬 P450 단일산소화효소 5 인디고 생합성 3 트립토판 할로겐화효소 3 플라빈 함유 단일산소화효소(FMO) 3 유전체 규모 대사 모델(GEM) 2 fatty acid metabolic engineering 2 s equol 2 미생물 지질 생산 2 self sufficient p450 2 hydroxy equol 2 isoflavone bioconversion 2 isoflavone reductase 2 indigoid dye 2
주요 방법론
genome scale metabolic modeling 2 omics analysis 1 원편광 이색성 분광법(CD) 1 semi rational protein engineering 1 transcriptomics 1 liquid chromatography mass spectrometry 1 structure based protein engineering 1 fluorescence activated cell sorting 1 random mutagenesis 1 molecular docking 1
대장균·효모 전세포 생촉매 반응과 대사공학이 연구의 중심이며, 초록에 명시된 방법으로는 게놈 규모 대사 모델링, 전사체 분석, 반합리적·구조 기반 단백질 공학, EMS 무작위 돌연변이와 형광활성세포분류(FACS) 선별, 분자 도킹, LC-MS 분석이 있다. 최근 논문에서는 CRISPR-Cas9 유전자 편집, CRISPRi 스크리닝과 CROP-seq, 친화정제-질량분석(AP-MS), 면역형광 영상을 사용했다.
NTIS 표준분류
화공 > 생물화학 공정기술 35% · 생명과학 > 생물공학 16% · 생명과학 > 산업바이오 13% · 생명과학 > 융합바이오 10% · 생명과학 > 분자세포생물학 6% · 화학·화공 합 35% · 배정 31편
화학·화공에 배정된 논문 수: 생물화학 공정기술 11
지원 과제 기준 논문 수: 생물화학 공정기술 1
논문 전체 SCI급 31편 · 최신순
31편집계에서 뺀 레코드 1건 (동명이인·학회 초록·표지·번역본·중복)
| 연도 | 제목 | 뺀 이유 |
|---|---|---|
| 2020 | Cover Feature: Characterization of a Tryptophan 6‐Halogenase from Streptomyces albus and Its Regioselectivity Determinants (ChemBioChem 10/2020) ChemBioChem | 학술지 표지·권두 그림 |
요약
김준원 교수는 공과대학 화학생물공학부 소속으로 단백질/효소 공학 및 대사공학을 연구한다. 2014년 이후 OpenAlex 기준 논문 39편(SCI급 31편, 그중 서울대 소속 30편), 피인용 합계 964회이다. 주력 학문분야는 Molecular Biology, Biotechnology, Organic Chemistry이다. NTIS 과학기술표준분류로는 화공 > 생물화학 공정기술(35%), 생명과학 > 생물공학(16%), 생명과학 > 산업바이오(13%) 순으로 가깝고, 그중 화학·화공은 35%다. 논문을 지원한 국가R&D 과제는 13건(연차 기준, 2020–24 성과)이다. 학부 내 공저 상대: 한지숙 1편.
핵심 연구주제
SCI급 논문의 OpenAlex 1순위 토픽 기준(편수). 서울대 부임 전 논문도 포함한다.
| 연구주제 | 학문분야 | 편 |
|---|---|---|
| Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction | Molecular Biology | 11 |
| Enzyme Catalysis and Immobilization | Molecular Biology | 5 |
| Microbial Metabolism and Applications | Biotechnology | 4 |
| 기타 토픽 | 2 | |
| Antimicrobial agents and applications | Organic Chemistry | 1 |
| 기타 토픽 | 1 | |
| 기타 토픽 | 1 | |
| 기타 토픽 | 1 |
연구 궤적
| 시기 | 논문 | 주요 주제 |
|---|---|---|
| 2014–2017 | 9 | Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction (3) · Microbial Metabolism and Applications (2) · 기타 토픽 (2) |
| 2018–2021 | 17 | Microbial Metabolic Engineering and Bioproduction (7) · Microbial Metabolism and Applications (2) · Enzyme Catalysis and Immobilization (2) |
| 2022–2026 | 5 | 기타 토픽 (1) · CRISPR and Genetic Engineering (1) · Enzyme Catalysis and Immobilization (1) |
AI 연구 프로필·과제 동향
김준원 교수는 화학생물공학부에서 단백질·효소 공학과 대사공학을 연구하며, 수집된 SCI 논문 대부분이 대장균·효모 같은 미생물 전세포 생촉매와 효소로 고부가 화합물을 생산하는 연구를 다룬다. 초기에는 게놈 규모 대사 모델을 이용한 방선균 항생제 생산 표적 발굴, 사이토크롬 P450을 이용한 오메가-하이드록시 지방산 생산, 장내세균 유래 환원효소를 이용한 (S)-에쿠올 생산을 주로 연구했다. 이후 할로게나제·플라빈 함유 단일산소화효소를 조합한 인디고·인디루빈·티리언 퍼플 등 인디고이드 염료 합성, 야로위아 효모의 지질·지방산 대사공학, 하이드록시 에쿠올의 위치선택적 합성으로 범위를 넓혔다. 2024–2025년 논문은 CRISPR 기반 내재 단백질 태깅, 세포 내 단백질 조직 지도화, 알츠하이머병 미세아교세포 유전자 스크리닝 등 인간 세포 기능유전체학을 다루어 주제가 크게 바뀌었다. 담관암 담즙산 바이오마커, 비브리오 콜레라 c-di-GMP 신호, 항균 표면 같은 공동연구 성격의 논문도 일부 포함되어 있다.
연구 축
연구 흐름
| 시기 | 흐름 | 그 시기 주요 키워드 |
|---|---|---|
| 2014–2017 | 방선균 Streptomyces coelicolor의 게놈 규모 대사 모델로 항생제 생산 증대 표적을 찾았고, 대장균에서 지방산 대사·보조인자 최적화와 CYP153A35 P450을 이용한 오메가-하이드록시 팔미트산 생산을 연구했다. 장내세균 유래 환원효소를 이용한 (S)-에쿠올·5-하이드록시 에쿠올 생산, 인디고를 만드는 자급형 P450(CYP102G4)의 특성 분석, 유지성 미생물 시스템생물학 리뷰도 이 시기에 나왔다. | 사이토크롬 P450 단일산소화효소 오메가-하이드록시 지방산 전세포 생촉매 인디고 생합성 self sufficient p450 |
| 2018–2021 | FadR 조절망 재설계, AlkL 수송체 최적화, 야로위아 효모의 무작위 돌연변이·합성 프로모터로 오메가-하이드록시 지방산 생산을 확장했고, 야로위아 대사 모델과 전사체 기반 균주 설계를 다루었다. 할로게나제·플라빈 함유 단일산소화효소를 이용한 인디고 유도체·인디루빈·티리언 퍼플 합성, 고분자 용매를 이용한 g/L 규모 (S)-에쿠올 생산, 효모의 (R)-아세토인 생산, 티로시나제를 이용한 식물 폴리페놀 수산화가 이어졌다. 담관암 바이오마커, 클라미도모나스 바이오매스, 트라가칸트 분해 세균, 항균 표면, 비브리오 콜레라 신호 등 공동연구 성격의 논문도 이 시기에 몰려 있다. | 오메가-하이드록시 지방산 전세포 생촉매 indigoid dye 트립토판 할로겐화효소 야로위아 리폴리티카 |
| 2022–2026 | 2022년에는 이소플라보노이드 환원효소와 단일산소화효소를 조합한 하이드록시-(S)-에쿠올의 위치선택적 원팟 합성과 트립토판에서 6-브로모인디루빈을 만드는 다효소 연쇄반응을 보고했다. 2024–2025년 논문은 CRISPR-Cas9 기반 고처리량 내재 단백질 태깅(HITAG), 영상과 상호작용 단백체를 결합한 세포 내 조직 지도화(HIT-MAP), iPSC 유래 미세아교세포에서 알츠하이머병 위험 유전자의 CRISPRi·CROP-seq 스크리닝을 다룬다. | endogenous protein tagging hydroxy equol isoflavone reductase regioselective hydroxylation selective estrogen receptor modulator |
핵심 키워드와 국가 과제 동향
| 키워드 | 논문 | 국가 10년(억) | 증가율 | 추이 2015–24 | 진단 |
|---|---|---|---|---|---|
| 오메가-하이드록시 지방산 | 6 | 40 | 소규모 | 국가 과제 매칭 적음 | |
| 전세포 생촉매 | 5 | 5 | 소규모 | 국가 과제 매칭 적음 | |
| 사이토크롬 P450 단일산소화효소 | 5 | 17 | 소규모 | 국가 과제 소규모 · 학부 논문 10편 미만 | |
| 인디고 생합성 | 3 | 28 | 소규모 | 국가 과제 매칭 적음 | |
| 트립토판 할로겐화효소 | 3 | 0 | – | 국가 과제 매칭 적음 | |
| 플라빈 함유 단일산소화효소(FMO) | 3 | 0 | – | 국가 과제 매칭 적음 | |
| 유전체 규모 대사 모델(GEM) | 2 | 272 | +23% | 국가 평균보다 느리게 증가 · 학부 논문 10편 미만 | |
| 미생물 지질 생산 | 2 | 0 | 소규모 | 국가 과제 매칭 적음 |
전체 키워드: 오메가-하이드록시 지방산 6 전세포 생촉매 5 사이토크롬 P450 단일산소화효소 5 인디고 생합성 3 트립토판 할로겐화효소 3 플라빈 함유 단일산소화효소(FMO) 3 유전체 규모 대사 모델(GEM) 2 fatty acid metabolic engineering 2 s equol 2 미생물 지질 생산 2 self sufficient p450 2 hydroxy equol 2 isoflavone bioconversion 2 isoflavone reductase 2 indigoid dye 2 야로위아 리폴리티카 2 multi enzyme cascade 2 endogenous protein tagging 2 antibiotic production 1 gene overexpression target 1
연구 방법
대장균·효모 전세포 생촉매 반응과 대사공학이 연구의 중심이며, 초록에 명시된 방법으로는 게놈 규모 대사 모델링, 전사체 분석, 반합리적·구조 기반 단백질 공학, EMS 무작위 돌연변이와 형광활성세포분류(FACS) 선별, 분자 도킹, LC-MS 분석이 있다. 최근 논문에서는 CRISPR-Cas9 유전자 편집, CRISPRi 스크리닝과 CROP-seq, 친화정제-질량분석(AP-MS), 면역형광 영상을 사용했다.
genome scale metabolic modeling 2 omics analysis 1 원편광 이색성 분광법(CD) 1 semi rational protein engineering 1 transcriptomics 1 liquid chromatography mass spectrometry 1 structure based protein engineering 1 fluorescence activated cell sorting 1 random mutagenesis 1 molecular docking 1
지원 과제 동향 (NTIS 성과, 2020–2024)
연도별 지원 과제 건수. 정부연구비 합계 2020 3억 · 2021 20억 · 2022 55억 · 2023 0억 · 2024 0억. 과제 전체의 연차 정부연구비를 더한 값이라 교수 개인 연구비가 아니며, 공저자 과제가 포함될 수 있다.
31편 중 13편은 초록이 없어 제목과 OpenAlex 키워드로만 태깅했다. 2024–2025년 3편은 인간 세포 기능유전체학으로 주제가 크게 달라지고 담관암 바이오마커·항균 표면·비브리오 신호 논문도 주 연구와 거리가 있으나, 단백질·효소 연구와 이어지는 경력 또는 공동연구로 볼 여지가 있어 suspect로 표시하지 않았다.
NTIS 표준분류 연계
이 교수 논문이 가장 많이 배정된 NTIS 중분류부터(화학·화공 밖 포함, 상위 15개). 논문 = 이 교수 논문을 그 분류에 배정한 수(정책 연계 맵과 같은 방법), 논문(지원 과제) = 그 분류 과제가 지원한 논문 수. 국가 투자 = 그 분류(1순위) 과제의 정부연구비 2015–24. 대학 내 서울대% 평균 8.7%.
배정 구성: 화공 > 생물화학 공정기술 35% · 생명과학 > 생물공학 16% · 생명과학 > 산업바이오 13% · 생명과학 > 융합바이오 10% · 생명과학 > 분자세포생물학 6% · 화학·화공 합 35% · 배정 31편
| 대분류 | 중분류 | 범위 | 논문 | 논문(지원 과제) | 국가 2015–24(억) | 2020–24(억) | 증가율 | 대학 내 서울대% |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 화공 | 생물화학 공정기술 | 화학·화공 | 11 | 1 | 2,846 | 1,506 | +12% | 2.4 |
| 생명과학 | 생명과학 > 생물공학 | 범위 밖 | 5 | 0 | 4,384 | 2,666 | +55% | 10.2 |
| 생명과학 | 생명과학 > 산업바이오 | 범위 밖 | 4 | 3 | 10,147 | 5,761 | +31% | 5.1 |
| 생명과학 | 생명과학 > 융합바이오 | 범위 밖 | 3 | 5 | 12,029 | 7,663 | +76% | 9.7 |
| 보건의료 | 보건의료 > 신약·의약품개발 | 범위 밖 | 2 | 2 | 43,312 | 27,450 | +73% | 10.5 |
| 생명과학 | 생명과학 > 분자세포생물학 | 범위 밖 | 2 | 0 | 11,140 | 6,519 | +41% | 12.5 |
| 생명과학 | 생명과학 > 바이오공정/기기 | 범위 밖 | 1 | 1 | 1,479 | 733 | ~2022 | 6.5 |
| 뇌과학 | 뇌과학 > 뇌의약 | 범위 밖 | 1 | 0 | 2,224 | 1,406 | +72% | 10.5 |
| 보건의료 | 보건의료 > 임상의학 | 범위 밖 | 1 | 0 | 26,429 | 17,081 | +83% | 6.5 |
| 재료 | 재료 > 고분자재료 | 범위 밖 | 1 | 0 | 16,986 | 10,510 | +62% | 7.0 |
논문 지원 과제 (NTIS 성과DB)
교수 논문 DOI가 NTIS 성과 논문으로 등록된 과제(2020–24). 공저자의 과제일 수 있어 본인 책임 과제와 같지 않다. 부처: 과학기술정보통신부 5, 교육부 3, 산업통상자원부 3, 다부처 2. NTIS 분류 = 그 과제의 1순위 과학기술표준분류.
| 연도 | 과제·사업 | 부처 | 수행기관 | 억 | NTIS 분류 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2022 | K-BIO 신성장동력 KIURI 인력양성 연구단 인재활용확산지원 | 과학기술정보통신부 | 서울대학 | 22.1 | – |
| 2022 | 화공분야연구인력양성사업단 4단계두뇌한국21사업(R&D) | 교육부 | 서울대학 | 10.0 | – |
| 2022 | 탄소-제로 신재생에너지시스템 사업단 4단계두뇌한국21사업(R&D) | 교육부 | 아주대학 | 6.5 | – |
| 2022 | 생물 전환 바이오 인디고 생산기술과 기능성 소재 제품화 기술개발 바이오산업기술개발 | 산업통상자원부 | 아주대학 | 6.3 | 범위 밖 |
| 2022 | 무혈성괴사(AVN) 치료를 위한 휘트로카이트가 가교화된 콜라겐-HA 기반 스캐폴드 개발 범부처전주기의료기기연구개발(산업부,복지부,과기부) | 다부처 | 서울대학 | 5.6 | 범위 밖 |
| 2022 | 이종 췌도세포 이식을 위한 체내 면역반응 조절 캡슐화 기술 개발 범부처재생의료기술개발사업 | 과학기술정보통신부 | 서울대학 | 4.4 | 범위 밖 |
| 2021 | 화공분야연구인력양성사업단 4단계두뇌한국21사업(R&D) | 교육부 | 서울대학 | 9.6 | – |
| 2021 | 식물유 유래 고부가 장쇄 다이아민diamine C10 생물학적 생산공정 기술개발 바이오산업기술개발(R&D) | 산업통상자원부 | 한국생명공학연구원 | 4.9 | 범위 밖 |
| 2021 | (주관)무혈성괴사(AVN) 치료를 위한 휘트로카이트가 가교화된 콜라겐-HA 기반 스캐폴드 개발 범부처전주기의료기기연구개발사업(R&D)(과기정통부,복지부,산업부) | 다부처 | 서울대학 | 4.0 | 범위 밖 |
| 2021 | Yarrowia lipolytica 세포공장의 다수준 최적화를 위한 OLIVE (OLeaginous yeast Innovative VEctor) toolbox 개발 개인기초연구(과기정통부)(R&D) | 과학기술정보통신부 | 서울대학 | 2.0 | 범위 밖 |
| 2020 | Yarrowia lipolytica 세포공장의 다수준 최적화를 위한 OLIVE (OLeaginous yeast Innovative VEctor) toolbox 개발 개인기초연구(과기정통부)(R&D) | 과학기술정보통신부 | 서울대학교 | 3.0 | 범위 밖 |
| 2020 | 세포분열주기 의존적인 비멘틴 인산화를 실시간으로 시각화 가능한 형광 항체 센서 개발 개인기초연구(과기정통부)(R&D) | 과학기술정보통신부 | 홍익대학교(세종캠퍼스) | 0.3 | 범위 밖 |
| 2019 | 천연향료 아세토인의 생물학적 대량생산기술 개발 바이오산업핵심기술개발(R&D) | 산업통상자원부 | 서울대학교산학협력단 | 1.0 | 화공 > 생물화학 공정기술 > 발효공정기술 |
학부 내 협업 (공저)
| 교수 | 연구분야 | 공저 편수 | 공저 논문 예 |
|---|---|---|---|
| 한지숙 | 생물 및 환경 | 1 | High-yield production of (R)-acetoin in Saccharomyces cerevi |
학제 간 융합 후보
연구분야가 겹치지 않고 아직 함께 쓴 논문이 없는 교수 쌍 가운데 연구 유사도(학문분야 cosine 0.5 + NTIS 중분류 cosine 0.5)가 높은 순. NTIS 쪽은 화학·화공 밖 분류까지 넣어 계산한다. 겹치는 NTIS 분류는 두 교수 논문이 2편 이상씩 배정된 중분류(범위 밖이면 링크 없음)다. 전체 네트워크 →
조건을 만족하는 후보 없음
대표 논문 (피인용 상위)
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교수 1
논문 31
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연구주제 8
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학문분야 3
Molecular Biology · Organic Chemistry · Biotechnology
정책분야 1
연구분야 1
키워드 9
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